福建医科大学附属协和医院心脏外科是福建省集医疗、教学和科研为一体的心脏医学中心，省十个临床重点学科之一，省外科学唯一博士点，全国心脏外科继续教育基地之一。拥有福建省胸心外科研究所和福建省冠心病研究所，下设复杂先心病、瓣膜病、心肌保护、心脏移植等9个研究室。心脏外科是由普通病房、ICU、心外科手术室、心脏外科麻醉组和体外循环组等5部分组成；设病床67张，ICU 16张；4个无菌手术间；现有医护人员80余人，主任医师、教授5人，副主任医师、副教授5人，博士12人，硕士2人，跨世纪百千万阶梯人才6人，博导3人，硕导4人。8位青年医生在美国、意大利、英国、日本、法国和德国等10个国家做1年以上访问学者或博士后研究。
心脏外科拥有目前世界上最先进的大型先进医疗设备数十台，包括Stockert-III型体外循环机、Bear及Drager牌成人和婴幼儿专用呼吸机、Siemens麻醉机、Vivid术中心脏彩超、Sarns离心泵、Hemonetics血液回收机、Datascope主动脉内球囊反搏机、Baxter持续心排量监测仪、HP中央监护系统、Nova血气分析仪等。每日可完成常规心脏手术10～15台，近5年年手术量以15%的速率逐年增加。全省第一流的中央电脑监控重症监护病房是“全国青年文明号”，以国际一流模式装备及管理，ICU医护人员术后重症监护经验极其丰富，承担全省危重
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危重病人的抢救和省内外重症监护医护人员的培训工作。
心脏外科每年完成心脏手术台数列全国综合性医院的前列，近5年年手术量均高居全省第一，2005年在院内完成心脏手术1187台,2006年达1345台，在全国10强之列，心脏手术总死亡率1.8%是全省最低，也远远低于全国心脏手术平均死亡率；近5年开展新技术、新项目25项，国内继续领先项目4 项，省内继续领先项目28项。成功开展心脏移植103例，心肺移植5例，长期存活88例，最长存活时间已经近12年（全国第二）。完成例数、手术成功率和患者长期存活率及生活质量均居全国前列，创造了“13个全国第一”：其中儿童心脏移植和心肾联合移植填补国内空白，并完成了亚洲首例人工心脏置换术后心脏移植手术；已成为我国心脏移植中心基地之一；电视全胸腔镜下体外循环先心房间隔缺损修补手术在省内率先开展，成为国内第二家能独立开展该手术的单位；冠状动脉搭桥技术处于国内一流和省内领先水平；生长因子转基因治疗心肌梗塞项填补国内空白；急诊冠状动脉搭桥，不停跳冠状动脉搭桥，冠状动脉搭桥合并室壁瘤切除等技术填补省内空白。开展数十种婴幼儿复杂先心病矫治手术，其中大动脉调转手术30余例，新生儿复杂心脏手术年龄最小的31小时，体重最小的为2公斤。大血管疾病的外科治疗迅速发展，处于国内先进行列，其中主动脉弓全弓置换术，Bentall手术，象鼻技术，内衬支架置入术和急诊夹层动脉瘤手术等多项技术均为省内领先。
协和心脏外科共承担国家、省部级等课研项目23项；在研的教育部、省教委、省科委、卫生厅等科研攻关课题16项，其中重大课题4项，共有科研经费200多万元，获国家级、省部级科技进步奖共18项；每年在SCI和国家级I级刊物发表论文20余篇，现已在权威学术刊物上发表论文350余篇，编写12部专著；承担福建医科大学本科、硕士和博士研究生的教学工作，以及国家级和省级医学继续教育培训。
协和心脏外科全体人员朝气蓬勃、团结奋进，开拓创新，被省政府授予“五一”劳动奖章。他们以“严谨、求精、勤奋、奉献”的协和精神为指导，走创新之路，发展和壮大心血管外科事业，努力建成为我国东南最重要的心脏中心，为我国的心血管外科事业的发展作出重大贡献。
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